El delito me parece que ni lo explican.
Ya lo explico Kyle Reese en la primera peli: Capturaban a los humanos para encerrarlos en campos de concentracion y exterminarlos, aunque dejaban unos pocos supervivientes para recoger los cadaveres, realizar trabajos forzados, etc. Es decir, igual que en el Holocausto, campos de exterminacion para los judios, II Guerra Mundial...
Me parece que el topo era la propia señal que los de la Resistencia encontraron en no se que frecuencia. Es decir, un señuelo para que Skynet localizara al Alto Mando.