Me refiero a la LC02 porque creo que es de lo poco que se ajusta a tu espacio. El aluminio es buen disipador del calor, pero tampoco es la panacea.

Las placas mini itx ademas de ocupar menos espacio, tienen un menor consumo, con lo cual disipan menos calor.

Todo depende de la conectividad que necesites, aunque esa caja con la poca altura que tiene imagino que solo admitira 2 tarjetas a traves de un riser card.

Si solo vas a montar una tarjeta de expansion, optaria por la mini itx, creo que en su ranura pci express 16x se puede montar una sintonizadora pci ex 1x, por lo menos en una de las configuraciones de Verybox, la incluyen.