Lo primero que deberías haces es desactivar el "escaneo automático" de ficheros. Esa parece ser una de las fuentes de corrupción en los firmwares SDK4 de Woxter. Y lo segundo sería intentar recuperar los ficheros perdidos con algún programa tipo Scandisk que exista para el OS X. Además, mientras no repares el sistema de archivos sería conveniente que no siguieras escribiendo en él. Escribir en un sistema de ficheros con errores incrementa las posibilidades de perder definitivamente, al menos en parte, los ficheros ahora no visibles.

¿Nadie de tu entorno cercano tiene un PC con Windows? ¿Un portátil que te puedan llevar a casa? ¿Un sobremesa de algún amigo/familiar al que acercarle el reproductor? Lo más probable es que con el Scandisk se solucionara (todo o en parte)... Y siendo un programa que va incluido en todos los Windows... Yo, por si las moscas, aunque uso una distribución de Linux, tengo un Windows en una partición aparte para cuando necesito ejecutar un programa que no tiene alternativa en Linux o que, aun teniéndola, me guste más el programa de Windows. Es el tributo que hay que pagar por el monopolio...

Saludos.