Yo recientemente hice el habitual "upgrade" de hardware y entre las cosas a mejorar estaba el añadir una unidad M.2 como disco de sistema, reemplazando un SSD.

Usé una aplicación de la propia Samsung para realizar un clonado del SSD a la M.2, y sin problema alguno.

Se llama Samsung Data Migration, y supongo que valdrá para cualquier SSD:

https://www.samsung.com/semiconducto...ownload/tools/

De modo genérico tienes una aplicación gratuita llamada Minitool partition wizard, que hace lo mismo:

https://www.partitionwizard.com/free...n-manager.html