Ya sé por qué no reproduce MKV, es por la compresión de headers en el video. Hay que desactivarla con el MKVMergeGUI o usar la versión 4.0.
Los subtítulos no los muestra, es decir, no tiene soporte para archivos .SRT. Lo que hice fue vender mi bluray y comprar un reproductor multimedia (con soporte a practicamente todos los formatos de video, audio DTS y subtítulos) y a la vez es un enclosure. Para rematar lo vergón que es, hasta puede descargar torrents por medio de WiFi.
En eBay hay muchos y son baratísimos.