Hola Kasio, tu solucion al final parece la mas efectiva,de hecho los woxter llevan el ventilador donde tu lo has colocado, de ahi, que este la toma de 12v en la esquina.
Una pregunta, ¿Por que no colocaste el ventilador de la grafica directamente encima del disipador del chip?, tendrias menos altura, y ademas refrigerarias dirctamente el radiador del chip, sin nada intermedio, eso si, tendrias el mismo ruido.
saludos.